Программа Русской Классической Школы полностью разработана с четырёх лет до четвёртого класса включительно. Дети, получившие такое начальное образование, имеют системные и глубокие знания по всем предметам, стойко сформированные навыки грамотного и красивого письма, они уверенно владеют вычислительными навыками устного счёта и письменных вычислений, хорошо решают достаточно сложные арифметические задачи. Эта база даёт возможность ребёнку успешно обучаться по любой программе средней школы.
В настоящее время обучение в основной школе планируется по программам, разработанным в соответствии с примерной программой основного общего образования, с преподаванием ряда предметов на углубленном уровне и по учебникам, разработанным лучшими российскими и советскими педагогами.